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clade は現代フランス語では生物学用語のクレード(単系統群)を意味するが、その用法の出現は20世紀半ばのことなので(*1)、当然ノストラダムスの時代にはそんな単語はなかった。 古語辞典の類にも一切載っていないが(*2)、ラテン語の clades (損害、災禍) をフランス語に持ち込んだものと見なされている。これはアナトール・ル・ペルチエ(1867年)の指摘以来、実証主義的な論者たちの間でも異論がない。 登場箇所 百詩篇第4巻5番 ほかに暦書の散文にも登場例がある(*3)。また、フランス革命期の偽の百詩篇にも使用している詩篇がある。 名前 コメント
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↑生物 細菌の系統 細菌 / バクテリア (Bacteria) = 真正細菌 (Eubacteria) incertae sedis Aminanaerobia, Caldus, Candidatus, Catenispora, Chlorochromatium, Deinonema, Denitromonas, Fervidomicrobium, Guhaiyinggella, Nanobacterium, Natronohydrobacter, Pseudoburkholderia, Pseudogluconobacter, Ruminobacillus, Scopulibacillus, Smegmaraptor, Streptofusia, Thermobaculum, Thermosulfidibacter 他 incertae sedis クテドバクター綱 (Ktedobacteria) = クテドノバクテリア (Ktedonobacteria) incertae sedis ディクチオグロムス門 (Dictyoglomi) incertae sedis ゲマティモナス門 (Gemmatimonadetes) incertae sedis ニトロスピラ門 (Nitrospirae) = Thermodesulfovibrio group incertae sedis シネルギステス門 (Synergistetes) incertae sedis N.N.デフェリバクター門 / デフェリバクター綱 (Deferribacteres) サーモデスルフォバクター門 / テルモデスルフォバクテリウム門 (Thermodesulfobacteria) ファーミキューテス (Firmicutes) = グラム陽性細菌 (Gram-positive bacteria) = 発酵菌門incertea sedis Dethiobacter 他 incertea sedis テルモリトバクター綱 (Thermolithobacteria)クロストリディウム綱 / クロストリジウム綱 (Clostridia) N.N.モリクテス (Mollicutes) = テネリクテス (Tenericutes) バチルス綱 (Bacilli) N.N.N.N.N.N.プランクトミセス門 (Planctomycetes) = プランクトミセス綱 (Planctomycetacia) スピロヘータ門 / スピロケータ門 / スピロヘータ綱 / スピロケータ綱 (Spirochaetes) アクチノバクテリア / 放線菌門 / 放線菌綱 / 放線菌関連細菌 (Actinobacteria) フィブロバクター門 (Fibrobacteres) = フィブロバクテリア (Fibrobacteria) Bacteroidetes/Chlorobi groupincertae sedis クロロビウム門 (Chlorobi) = 緑色硫黄細菌 (green sulfur bacteria) バクテロイデス門 (Bacteroidetes) = Bacteroides‐Cytophaga‐Flexibacter group = BCF group Chlamydiae/Verrucomicrobia groupincertae sedis クラミジア門 / クラミディア門 (Chlamydiae) レンティスファエラ門 (Lentisphaerae) ヴェルコミクロビウム門 (Verrucomicrobia) N.N.N.N.N.N.クリシオゲネス門 / クリシオジェネス門 / クリシオゲネス綱 (Chrysiogenetes) = クリシオジェネス目 (Chrysiogenales) = クリシオジェネス科 (Chrysiogenaceae) = クリシオジェネス属 (Chrysiogenes) = クリシオジェネス・アルセナティス (Chrysiogenes arsenatis) フソバクテリウム門 / フソバクテリア (Fusobacteria) 超好熱性真性細菌サーモトガ門 / テルモトガ門 / サーモトーガ門 / サーモトガ綱 / テルモトガ綱 (Thermotogae) アクイフェックス門 / アキフェックス門 / アクイフェックス綱 / アキフェックス綱 (Aquificae) クロロフレクスス門 / クロロフレクサス門 (Chloroflexi) = 緑色非硫黄細菌 (green nonsulfur bacteria = green non‐sulfur bacteria)incertae sedis Candidatus, Kouleothrix 他アナエロリネア綱 (Anaerolineae) カルディリネア綱 (Caldilineae) = カルディリネア目 (Caldilineales) = カルディリネア科 (Caldilineaceae) クロロフレクスス綱 / クロロフレクサス綱 (Chloroflexi) デハロココイデス綱 (Dehalococcoidetes) テルモミクロビウム綱 / テルモミクロビウム門 (Thermomicrobia) デイノコッカス・サーマス門 / デイノ コックス・テルムス門 (Deinococcus‐Thermus) = Thermus/Deinococcus groupincertae sedis デイノコッカス門 / デイノコックス門 / デイノコッカス綱 / デイノコックス綱 (Deinococci) シアノバクテリア / 藍色細菌 / 藍菌 (Cyanobacteria) / 藍藻 (Cyanophyta) アシドバクテリウム門 / アシドバクテリア (Acidobacteria)ホロファガ綱 (Holophagae) = subdivision 8ホロファガ目 (Holophagales) アカントプレウリバクター目 (Acanthopleuribacterales) subdivision 7 N.N.subdivision 6 N.N.subdivision 4 = subdivision 5 sensu Fukunaga et al. N.N.subdivision 5 = subdivision 4 sensu Fukunaga et al. N.N.subdivision 1 N.N.subdivision 3 subdivision 2 プロテオバクテリア (proteobacteria) = 紅色非硫黄細菌 (purple non‐sulfur bacteria) = 紅色細菌 (purple bacteria)incertae sedis Aminomonas, Aquamarinicola, Magnetococcus, Mariprofundus 他デルタプロテオバクテリア (Deltaproteobacteria) = δプロテオバクテリア (δ‐proteobacteria) N.N.イプシロンプロテオバクテリア (Epsilonproteobacteria) = εプロテオバクテリア(ε‐proteobacteria) N.N.アルファプロテオバクテリア (Alphaproteobacteria) = αプロテオバクテリア(α‐proteobacteria) N.N.ベータプロテオバクテリア (Betaproteobacteria) = βプロテオバクテリア(β‐proteobacteria) ガンマプロテオバクテリア (Gammaproteobacteria) = γプロテオバクテリア (γ‐proteobacteria)incertae sedis アルテロモナス目 (Acidithiobacillales) incertae sedis エアロモナス目 (Aeromonadales) incertae sedis カルディオバクテリウム目 (Cardiobacteriales) incertae sedis クロマチウム目 (Chromatiales) incertae sedis メチロコックス目 (Methylococcales) incertae sedis オセアノスピリルム目 (Oceanospirillales) incertae sedis チオスリックス目 (Thiotrichales) incertae sedis キサントモナス目 (Xanthomonadales) incertae sedis 所属不明属多数レジオネラ目 (Legionellales) キサントモナス目 (Xanthomonadales) N.N.シュードモナス目 (Pseudomonadales) N.N.アルテロモナス目 (Alteromonadales) N.N.ビブリオ目 (Vibrionales) N.N.パスツーレラ目 (Pasteurellales) エンテロバクター目 / 腸内細菌目 (Enterobacteriales) ITOLをベースに。ブートストラップ 50は多分岐にしました。 ITOLと矛盾しない範囲で、適宜他のソースも使っています。クリシオゲネス門、デフェリバクター門、サーモデスルフォバクター門の位置は16SrRNAによるものです。 レンティスファエラ門とヴェルコミクロビウム門はソースに含まれていませんが、Chlamydiae/Verrucomicrobia groupを単系統と考えクラミジア門の近くに入れました。 ITOLではプロテオバクテリアの単系統性は弱く否定されていますが、ここでは単系統としました。Fibrobacteres/Acidobacteria groupの単系統性は強く否定されています。 伝統的な意味でのグラム陽性菌、グラム陰性菌は単系統とはなりません。グラム陽性菌は、系統的にはファーミキューテス門のシノニムとして使われますが、他に放線菌などもグラム陽性です。 Ciccarelli et al. 2006 Fukunaga et al. 2008 Interactive Tree Of Life MMID 微生物分類同定講座 第4回 細菌の分類体系 Taxonomy browser (Bacteria) きまぐれ生物学 生物分類表 真性細菌ドメイン
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古細菌 (Archaebacteria) = アーキア / アーケア / 始原菌 (Archaea) コルアーキオータ / コルアーキオタ / コル古細菌 (Korarchaeota) = コルアーキア (Korarchaea) ユーリ古細菌 + クレン古細菌クレン古細菌 / クレンアーキオータ / クレンアーキオタ / クレナーキオータ / クレナーキオタ / クレンアーケオータ / クレンアーケオタ (Crenarchaeota) = クレンアーキア (Crenarchaea)Incertae sedis カルディスファエラ目 (Caldisphaerales)サーモプロテウス目 (Thermoproteales) N.N.センアーケウム目 (Cenarchaeales) デスルフロコッカス目 + スルフォロブス目スルフォロブス目 (Sulfolobales) デスルフロコッカス目 (Desulfurococcales) ユーリ古細菌 / ユリアーキオータ / ユーリアーキオータ / ユリアーキオタ / ユリアーケオタ (Euryarchaeota) = ユーリアーキア (Euryarchaea)サーモコッカス綱 + ナノアーキオータナノ古細菌 / ナノアーキオータ / ナノアーキオタ (Nanoarchaeota) = ナノアーキア (Nanoarchaea) サーモコッカス綱 (Thermococci) N.N.N.N.メタノピルス目 / メタノピラス目 (Methanopyrales = Methanopyri) メタノコッカス目 + メタノバクテリウム目メタノバクテリウム目 (Methanobacteriales = Methanobacteria) メタノコッカス目 (Methanococcales = Methanococci) サーモプラズマ綱 (Thermoplasmata) N.N.アーケオグロブス目 / アーキオグロバス目 (Archaeoglobales = Archaeoglobi) メタノミクロビウム綱 + ハロバクテリアハロバクテリア / 高度好塩菌 (Halobacteria) メタノミクロビウム綱 (Methanomicrobia)メタノセラ目 (Methanocellales) = メタノセラ科 (Methanocellaceae) = RC‐I メタノミクロビウム目 (Methanomicrobiales) メタノサルシナ目 (Methanosarcinales) = メタン菌 / メタン生成菌 (Methanogen) Gribaldo and Brochier-Armanet 2006を元に、適宜他のソースを参考にしました。 Gribaldo and Brochier-Armanet 2006
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緑色植物の系統 緑色植物 (Viridiplantae) = 緑色生物 (Chlorobiota = Chlorobionta) = 緑色色素体類 (Chloroplastida) 緑藻植物 (Chlorophyta) プラシノコックス目 (Prasinococcales) = プラシノコックス系統 (Prasinococcus‐clade) = プラシノ藻VI (Prasinophyceae VI) N.N.N.N.マミエラ目 (Mamiellales) = マミエラ系統 (Mamiella‐clade) = プラシノ藻II (Prasinophyceae II) N.N.ピラミモナス目 (Pyramimonadales) = ピラミモナス系統 (Pyramimonas‐clade) = プラシノ藻I (Prasinophyceae I) ユーグレナ藻類の色素体 N.N.シュードスコウルフィエルディア目 / プセウドスコウルフィールディア目 (Pseudoscourfieldiales) = ピクノコックス科 (Pycnococcaceae) = シュードスコウルフィエルディア系統 (Pseudoscourfieldia‐clade) = プラシノ藻V (Prasinophyceae V) N.N.ピコシスティス系統 (Picocystis‐clade) = プラシノ藻VIII (Prasinophyceae VIII) プラシノ藻VII (Prasinophyceae VII) N.N.ネフロセルミス目 (Nephroselmidales) = ネフロセルミス系統 (Nephroselmis‐clade) = プラシノ藻III (Prasinophyceae III) N.N.ペディノモナス系統 (Pedinomonas‐clade) = プラシノ藻IX (Prasinophyceae IX) テトラセルミス下門 (Tetraphytae)N.N.テトラセルミス系統 (Tetraselmis‐clade) = プラシノ藻IV (Prasinophyceae IV) = クロロデンドロン目 (Chlorodendrales) = クロロデンドロン科 (Chlorodendraceae) クロララクニオン藻類の色素体 狭義の緑藻植物 (Chlorophyta sensu stricto) = 広義の緑藻 (Chlorophyceae sensu lato)アオサ藻 (Ulvophyceae) N.N.トレボウクシア藻 (Trebouxiophyceae) = プレウラストルム藻 (Pleurastrophyceae) = 広義のミクロタムニオン目 (Microthamniales) ゲミネラ系統 (Geminella‐clade) 緑藻 (Chlorophyceae) ストレプト植物 / 連鎖植物 (Streptophyta) = シャジクモ植物 (Charophyta)クロロキブス (Chlorokybophyceae = Chlorokybales = Chlorokybus atmophyticus) = クロロキブス系統 (Chlorokybus‐clade) メソスティグマ (Mesostigmata = Mesostigmatophyceae = Mesostigmatales = Mesostigma viride) = メソスティグマ系統 (Mesostigma‐clade) N.N.クレブソルミジウム目 (Klebsormidiales = Klebsormidiophyceae) = クレブソルミジウム系統 (Klebsormidium‐clade) コレオケーテ目 (Coleochaetophyceae = Coleochaetales) = カエテ亜綱 (Chaetophycidae) = コレオケーテ系統 (Coleochaete‐clade) ホシミドロ綱 (Zygnematophyceae = Zygnemophyceae) = 接合藻 (Conjugatophyceae) = 接合植物(Gamophyta) = ホシミドロ系統 (Zygnema‐clade)チリモ目 (Desmidiales) ホシミドロ目 (Zygnematales = Zygnemoideae) = 真正接合藻 (Euconjugatae) 連鎖植物亜門 (Streptophytina) = シャジクモ系統 (Chara‐clade)車軸藻 / シャジクモ / シャジクモ藻 (Charophytae = Charophyceae = Charales) 陸上植物 (Embryophyta) = 茎葉植物 (Cormophyta) = (狭義の)植物 (Plantae) Proschold Leliaert 2007 を元にしました。プラシノ藻の一部は Turmel et al. 2009、緑藻は Turmel et al. 2008、メソスティグマの位置は Robbens et al., 2007 によりました。 「プラシノ藻 (Prasinophytae = Prasinophyceae) = 緑色植物 - 狭義の緑藻植物 - ストレプト植物」は側系統です。従来プラシノ藻に含まれていたメソスティグマ、ストレプト植物に入れることが多いようです。クロロデンドロン目を除くこともあります。 「シャジクモ植物」は、伝統的な定義では陸上植物を含みませんが、系統学的な定義では含みます。 アオサ藻 アオサ藻 (Ulvophyceae) ミドリゲ類スミレモ系統 (Trentepohlia‐clade) = スミレモ目 (Trentepohliophyceae = Trentepohliales) N.N.シオグサ系統 (Cladophora‐clade) = シオグサ目 (Cladophorophyceae = Cladophorales) = ミドリゲ目 (Siphonocladales) N.N.カサノリ系統 (Acetabularia‐clade) = カサノリ目 (Dasycladophyceae = Dasycladales) ハネモ目 (Bryopsidophyceae = Bryopsidales) = イワヅタ目 (Caulerpales) = ミル目 (Codiales)狭義のハネモ目 (Bryopsidales) サボテングサ目 (Halimedales) コディオルム藻 (Codiolophyceae) = ヒビミドロ類イグナチウス系統 (Ignatius‐clade) ウミイカダモ系統 (Oltmannsiellopsis‐clade) = ウミイカダモ目 (Oltmannsiellopsidales) N.N.N.N.アクロシフォニア系統 (Acrosiphonia‐clade) トリコサルシナ系統 (Trichosarcina‐clade) N.N.シュードネオクロリス系統 (Pseudoneochloris‐clade) クロロシスティス系統 (Chlorocystis‐clade) strain MBIC 10461 アオサ目 (Ulvales)ピルラ系統 (Pirula‐clade) ボルボコレオン系統 (Bolbocoleon‐clade) アオサ系統 (Ulva‐clade) ネジレミドリ系統 (Phaeophila‐clade) ハネモ目の位置は解析されていないので、Lewis McCourt 2004 によりました。 ヒビミドロ目 (Ulotrichales) = ヒビミドロ類 - ウミイカダモ目 - アオサ目 は側系統です。 トレボウクシア藻 トレボウクシア藻 (Trebouxiophyceae) = プレウラストルム藻 (Pleurastrophyceae) = 広義のミクロタムニオン目 (Microthamniales) オーキスティス系統 (Oocystis‐clade) プランクトネマの1種 (Planctonema sp.) N.N.クロレラ系統 (Chlorella‐clade) プロトテカ系統 (Prototheca‐clade) ラディオフィルム (Radiofilum conjunctivum) N.N.クロレラの1種 (Chlorella sp.) パリエトクロリス (Parietochloris pseudoalveolaris) N.N.コリシスティス系統 (Choricystis‐clade) ミクロタムニオン系統 (Microthamnion‐clade) パラドキシア (Paradoxia multiseta) コエノシスティス (Coenocystis inconstans) カワノリ系統 (Prasiola‐clade) N.N.レプトシラ系統 (Leptosira‐clade) ディクチオクロロプシス (Dictyochloropsis reticulata) N.N.ワタナベア (Watanabea reniformis) サッカロフィラ系統 (Saccharophila‐clade) ロボスフェラ系統 (Lobosphaera‐clade) N.N.ミルメシア系統 (Myrmecia‐clade) トレボウクシア系統 (Trebouxia‐clade) 従来の目は全て、多系統のようです。 Lewis McCourt 2004 での系統 トレボウクシア藻 (Trebouxiophyceae) = プレウラストルム藻 (Pleurastrophyceae) = 広義のミクロタムニオン目 (Microthamniales) クロロコックム目 (Chlorococcales) = クロレラ目 (Chlorellales) N.N.カワノリ目 (Prasiolales) N.N.ミクロタムニオン目 (Microthamniales) トレボウクシア目 (Trebouxiales) 緑藻 緑藻 (Chlorophyceae) N.N.サヤミドロ目 (Oedogoniales)ミコナステス系統 (Mychonasthes‐clade) サヤミドロ系統 (Oedogonium‐clade) = サヤミドロ藻 (Oedogoniophyceae) N.N.ケートペルティス系統 (Chaetopeltis‐clade) = カエトペルチス目 / ケトペルティス目 (Chaetopeltidales) ケートフォラ系統 (Chaetophora‐clade) = CW/DO = カエトフォラ目 / ケトフォラ目 (Chaetophorales) N.N.ヨコワミドロ目 (Sphaeropleales)ブラクテアコックス系統 (Bracteacoccus‐clade) ゾフィンギエンシス系統 (Zofingiensis‐clade) N.N.ヨコワミドロ系統 (Sphaeroplea‐clade) シュードスクレデリア (Pseudoschroederia sp.) N.N.シュードムリエラ系統 (Pseudomuriella‐clade) イカダモ系統 (Scenedesmus‐clade) N.N.アオミドロ系統 (Hydrodictyon‐clade) ネオクロリス系統 (Neochloris‐clade) アンキストロデスムス系統 (Ankistodesmus‐clade) シュドエレリア系統 (Schroederia setigera‐clade) ボルボックス目 / オオヒゲマワリ目 (Volvocales) = クラミドモナス目 (Chlamydomonadales) = CWグループ (CW‐group)クルシフェラ系統 (Crucifera‐clade) N.N.トレウバリア系統 (Treubaria‐clade) ハフニオモナス (Hafniomonas reticulata) コナミドリムシ系統 (Reinhardtii‐clade) オーガモクラミス系統 (Oogamochlamys‐clade) クロロモナス系統 (Chloromonas‐clade) モエウシイ系統 (Moewusii‐clade) N.N.ファコトゥス系統 (Phacotus‐clade) モナディナ系統 (Monadina‐clade) カラシオシフォン系統 (Characiosiphon‐clade) N.N.スペルマトゾプシス (Spermatozopsis similis) ラディオサ系統 (Radiosa‐clade) N.N.ジスモルフォコックス (Dysmorphococcus globosus) ドナリエラ系統 (Dunaliella‐clade) ポリトマ系統 (Polytoma‐clade) クラミドモナス・テトラガマ (“Chlamydomonas” tetragama) N.N.ヤリミドリ系統 (Chlorogonium‐clade) ステファノスフェラ系統 (Stephanosphaera‐clade) 目の関係は Turmel et al. 2008 によりました。 Adl et al., 2005の分類 緑色植物 (Viridiplantae) = 緑色生物 (Chlorobionta = Chlorobiota) = 緑色色素体類 (Chloroplastida) 緑藻植物 (Chlorophyta)アオサ藻 (Ulvophyceae) トレボウクシア藻 (trebouxiophyceae) = プレウラストルム藻 (Pleurastrophyceae) / ミクロタムニオン目 (Microthamniales) 緑藻 (Chlorophyceae) クロロデンドロン目 (Chlorodendrales) プラシノ藻 (Prasinophytae = Prasinophyceae) メソスティグマ (Mesostigma = Mesostigmata = Mesostigmatales = Mesostigmatophyceae) シャジクモ藻 / シャジクモ植物 (Charophyta = Charophyceae) [連鎖植物以外の下位タクサは省略されている]連鎖植物亜門 (Streptophytina)車軸藻目 / シャジクモ目 (Charales = Charophytae) 陸上植物 (Embryophyta) = 茎葉植物 (Cormophyta) = (狭義の)植物 (Plantae) 文献 きまぐれ生物学 謎の藻類メソスティグマの安住の地 IV(2007.05.17) Robbens et al., 2007 の紹介 きまぐれ生物学 緑藻色素体のスピンオフIV(2008.02.12) Takahashi et al. 2007 の紹介 きまぐれ生物学 緑藻綱の進化の順序(2008.06.11) Turmel et al. 2008 の紹介 きまぐれ生物学 ミドリムシの緑の源(2009.03.02) Turmel et al. 2009 の紹介 Lewis McCourt 2004. Green Algae and the Origin of Land Plants. Pombert et al. 2004. The Complete Mitochondrial DNA Sequence of the Green Alga Pseudendoclonium akinetum (Ulvophyceae) Highlights Distinctive Evolutionary Trends in the Chlorophyta and Suggests a Sister-Group Relationship Between the Ulvophyceae and lorophyceae Proschold Leliaert 2007. Systematics of the green algae conflict of classic and modern approaches.
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↑真核生物 Bass et al. 2005 を改変 リザリア (Rhizaria) 放散虫 / 放射虫 / ラジオゾア (Radiozoa)多泡類 / ポリキスティナ綱 (Polycystinea) N.N.棘針類 / アカンタリア綱 (Acantharea) スチコロンケ類 (Sticholonchea = Taxopodida) = スチコロンケ (Sticholonche) core Rhizariaincertae sedis ヘルケシマスティクス (Helkesimastix)有孔虫 (Foraminifera) ケルコゾア / アメーバ鞭毛虫 (Cercozoa) [+ 単胞子虫・グロミア]内粘液類 (Endomyxa)N.N.グロミア類 (Gromiidea = Gromiida) = グロミア (Gromia) アセトスポラ (Ascetosporea)パラミクサ類 (Paramyxea) 略胞子虫 / 単胞子虫 (Haplosporidia) N.N.Novel Clades 8 9 の一部 N.N.Novel Clades 8 9 の一部 フィトミクサ類 (Phytomyxea) = ネコブカビ類 (Plasmodiophorida = Plasmodiophoromycota = Plasmodiophoromycetes) = 広義のネコブカビ目 (Plasmodiophorida)ネコブカビ目 / ネコブカビ科 (Plasmodiophorida = Plasodiophoraceae) ファゴミクサ目 / ファゴミクサ科 (Phagomyxida = Phagomyxaceae) フィロサ / フィローサ (Filosa)incertae sedis Novel Clade 7 [+ Cercobodo agilis]メトロモナス類 (Metromonadida) = メトロモナス (Metromonas simplex) クロララクニオン藻 / クロララクニオン類 (Chlorarachnea = Chlorarachniophyta = Chlorarachniophyceae = Chlorarachnida = Chlorarachniidae) プロテオミクサ類 (Proteomyxidea) Novel Clade 5 メトピオン類 (Metopiida = Metopiidae) = メトピオン (Metopion) Novel Clade 6 モナドフィロサ / モナドフィローサ (Monadofilosa)ケルコモナス科 / セルコモナス科 (Cercomonadidae) ⊂サルコモナデア (Sarcomonadea)Clade A Clade B ヘテロミタ科 (Heteromitidae) = ボドモルファ科 (Bodomorphidae) ⊂サルコモナデア (Sarcomonadea) テコフィローセア (Thecofilosea) + 濃彩類Tectofilosida の一部 Pseudodifflugia などTectofilosida の一部 濃彩類 / パエオダリア / ファエオダリア (Phaeodarea) Novel Clade 4 N.N.Lecythium などTectofilosida の一部 (側系統) クリオモナス類 (Cryomonadida) N.N.N.N.basal ‘Group T’ (側系統) タウマトモナス類 (Thaumatomonadida = Thaumatomastigidae) = インブリカテア(Imbricatea) = シリコフィロセア (Silicofilosea) Novel Clade 1 [+ Pseudopirsonia mucosa] スポンゴモナス類 (Spongomonadida) Novel Clade 2 Novel Clade 3 ユーグリファ類 / ウロコカムリ目 (Euglyphida) アセトスポラ綱とグロミアを姉妹群としていますが、アセトスポラ綱のうち略胞子虫しか解析されていないようです。 ISOPの分類でのヌクレオフェレアはここでは採用されていません。プロテオミクサ類などがヌクレオフェレアに含まれるようです。(詳細不明) Tectofilosea = Tectofilosida + クリオモナス目 + Novel Clade 4 は側系統です。 Bass et al. 2005. Polyubiquitin Insertions and the Phylogeny of Cercozoa and Rhizaria. ISOPの分類による系統 (概略) リザリア (Rhizaria) ケルコゾア / アメーバ鞭毛虫 (Cercozoa)ケルコモナス目 / セルコモナス目 (Cercomonadida) シリコフィロセア (Silicofilosea) = インブリカテア(Imbricatea) クロララクニオン藻 / クロララクニオン植物 (Chlorarachniophyta) フィトミクサ類 (Phytomyxea) 濃彩類 / パエオダリア / ファエオダリア (Phaeodarea) ヌクレオフェレア (Nucleohelea) 略胞子虫 / 単胞子虫 (Haplosporidia) 有孔虫 (Foraminifera) グロミア (Gromia) 放散虫 (Radiolaria)多泡類 / ポリスキティナ (Polycystinea) スチコロンケ類 (Sticholonchea) = スチコロンケ目 (Taxopodida) = スチコロンケ (Sticholonche) 棘針類 / アカンタリア (Acantharia) (詳細) リザリア (Rhizaria) ケルコゾア / アメーバ鞭毛虫 (Cercozoa)Incertae sedis Cryothecomonas, Gymnophrys, Lecythium, Massisteria, Metopion, Proleptomonas, Pseudodifflugia.ケルコモナス目 / セルコモナス目 (Cercomonadida)ケルコモナス科 / セルコモナス科 (Cercomonadidae / Cercobodonidae) ヘテロミタ科 (Heteromitidae) = ボドモルファ科 (Bodomorphidae) シリコフィロセア (Silicofilosea) = インブリカテア(Imbricatea)タウマトモナス目 (Thaumatomonadida) = タウマトモナス科 (Thaumatomastigidae) ウロコカムリ目 / ユーグリファ目 (Euglyphida)incertae sedis Ampullataria, Euglyphidion, Heteroglypha, Matsakision.ウロコカムリ科 / ユーグリファ科 (Euglyphidae) フセウロコカムリ科 / トリネマ科 (Trinematidae) サイフォデリア科 / キフォデリア科 (Cyphoderiidae) パウリネラ科 (Paulinellidae) クロララクニオン藻 / クロララクニオン植物 (Chlorarachniophyta) フィトミクサ類 (Phytomyxea) 濃彩類 / パエオダリア / ファエオダリア (Phaeodarea)フェオコンキア (Phaeoconchia) フェオシスティナ (Phaeocystina) フェオグロミア (Phaeogromia) フェオスフェリア (Phaeosphaeria) ヌクレオフェレア (Nucleohelea)有殻太陽虫 / カゴメタイヨウチュウ目 (Desmothoracida) / クラスルリナ科 (Clathrulinidae) ギムノスフェリウム目 (Gymnosphaerida) 単胞子虫 (Haplosporidia) 有孔虫 (Foraminifera) グロミア (Gromia) 放散虫 (Radiolaria)多泡類 / ポリスキティナ (Polycystinea)スプメラリア (Spumellaria)コロダリア (Collodaria) スフェレラリア (Sphaerellaria) ナッセラリア (Nassellaria)プレクテラリア (Plectellaria) シルテラリア (Cyrtellaria) スチコロンケ類 (Sticholonchea) = スチコロンケ目 (Taxopodida) = スチコロンケ (Sticholonche) 棘針類 / アカンタリア (Acantharia)放射棘虫 / アカントメトラ目 (Arthracanthida) カウノカンティダ (Chaunocanthida) ホロカンティダ (Holocanthida) アンフィリチウム目 (Symphyacanthida)
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Pecon-Slattery et al. 2004; King et al. 2007 ネコ科 (Felidae) ヒョウ亜科 (Pantherinae) = Panthera lineageウンピョウ (Neofelis nebulosa) ヒョウ属 (Panthera)ユキヒョウ (Panthera uncia = Uncia uncia) トラ (Panthera tigris) N.N.ジャガー (Panthera onca) ライオン (Panthera leo) ヒョウ (Panthera pardus) ネコ亜科 (Felinae)マーブルキャット属 (Pardofelis) = Bay Cat lineageアジアゴールデンキャット (Pardofelis temminckii = Profelis temminckii = Catopuma temminckii) ボルネオヤマネコ (Pardofelis badia = Catopuma badia) マーブルキャット (Pardofelis marmorata) N.N.カラカル属 (Caracal) = Caracal lineageN.N.アフリカゴールデンキャット (Caracal aurata = Profelis aurata) カラカル (Caracal caracal) サーバル (Caracal servas = Leptailurus servas) オセロット属 (Leopardus) = Ocelot lineageN.N.マーゲイ (Leopardus wiedii) オセロット (Leopardus pardalis) N.N.パンパスネコ (Leopardus colocolo = Oncifelis colocolo = Lynchailurus colocolo) N.NN.N.ジョフロイネコ (Leopardus geoffroyi = Oncifelis geoffroyi) コドコド (Leopardus guigna = Oncifelis guigna) ジャガーネコ (Leopardus tigrinus) N.N.オオヤマネコ属 (Lynx) = Lynx lineageボブキャット (Lynx rufus) N.N.スペインオオヤマネコ (Lynx pardina) カナダオオヤマネコ (Lynx canadensis) ヨーロッパオオヤマネコ (Lynx lynx) Puma lineageピューマ (Puma concolor) ジャガランディ (Puma yagouaroundi = Herpailurus yagouaroundi) チーター (Acinonyx jubatus) N.N.ベンガルヤマネコ属 + マヌルネコベンガルヤマネコ属(Prionailurus) = Asian Leopard Cat lineageサビイロネコ (Prionailurus rubiginosus = Prionailurus rubiginosa) N.N.スナドリネコ (Prionailurus viverrinus = Prionailurus viverrina) N.N.ベンガルヤマネコ (Prionailurus bengalensis) マレーヤマネコ (Prionailurus planiceps = Ictailurus planiceps) マヌルネコ (Otocolobus manul) ネコ属 (Felis) = Domestic Cat lineageジャングルキャット (Felis chaus) N.N.クロアシネコ (Felis nigripes) N.N.スナネコ (Felis margarita) = Clade VI ネコ (Felis silvestris)ハイイロネコ (Felis silvestris bieti = Felis bieti) = Clade V ヨーロッパヤマネコ (Felis silvestris silvestris) = Clade I 南アフリカヤマネコ (Felis silvestris cafra) = Clade II 中央アジアヤマネコ (Felis silvestris ornata) = Clade III リビアヤマネコ + イエネコ (Felis silvestris lybica + Felis silvestris catus) = Clade IV Felis silvestris 内については Driscoll et al. 2007。 Driscoll et al. 2007. The Near Eastern Origin of Cat Domestication. King et al., 2007. Evolution of the Male-Determining Gene SRY Within the Cat Family Felidae Pecon-Slattery et al., 2004. Phylogenetic Assessment of Introns and SINEs Within the Y Chromosome Using the Cat Family Felidae As a Species Tree
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↑食肉類 現生イヌ科の系統 イヌ科 (Canidae) ハイイロギツネ属 (Urocyon) = ハイイロ・シマギツネクレード (grey and island fox clade)シマハイイロギツネ (Urocyon littoralis) ハイイロギツネ (Urocyon cinereoargenteus) N.N.アカギツネ類似クレード (red-fox-like clade)オオミミギツネ (Otocyon megalotis) タヌキ (Nyctereutes procyonoides) キツネ属 (Vulpes)N.N.フェネック / フェネックギツネ (Vulpes zerda) アフガニスタンキツネ / ブランフォードギツネ (Vulpes cana) N.N.ケープギツネ (Vulpes chama) N.N.N.N.ホッキョクギツネ (Vulpes lagopus = Alopex lagopus) キットギツネ (Vulpes macrotis) N.N.コサックギツネ (Vulpes corsac) N.N.オジロスナギツネ (Vulpes rueppelli) アカギツネ (Vulpes vulpes) イヌ族- タヌキ南アメリカクレード (South American clade)N.N.ヤブイヌ (Speothos venaticus) タテガミオオカミ (Chrysocyon brachyurus) N.N.コミミイヌ (Atelocynus microtis) N.N.カニクイイヌ / カニクイキツネ (Cerdocyon thous) クルペオギツネ属 / パンパスギツネ属 / クルペオ属 (Lycalopex = Pseudalopex)スジオイヌ (Lycalopex vetulus = Pseudalopex vetulus) N.N.ダーウィンギツネ(Lycalopex fulvipes = Pseudalopex fulvipes) N.N.N.N.チコハイイロギツネ (Lycalopex griseus = Pseudalopex griseus) パンパスギツネ (Lycalopex gymnocercus = Pseudalopex gymnocercus) N.N.クルペオギツネ / クルペオ (Lycalopex culpaeus = Pseudalopex culpaeus) セチュラギツネ (Lycalopex sechurae = Pseudalopex sechurae) オオカミ類似クレード (wolf-like clade) = 広義のイヌ属 (Canis sensu lato)N.N.ヨコスジジャッカル (Canis adustus) セグロジャッカル (Canis mesomelas) N.N.リカオン (Lycaon pictus = Canis pictus) N.N.ドール / アカオオカミ (Cuon alpinus = Canis alpinus) N.N.アビシニアジャッカル / シミエンジャッカル / シメニアジャッカル / シメニアオオカミ (Canis simensis) N.N.キンイロジャッカル (Canis aureus) N.N.コヨーテ (Canis latrans) タイリクオオカミ / オオカミ / イヌ (Canis lupus) Lindblad-Toh et al., 2005, Genome sequence, comparative analysis and haplotype structure of the domestic dog
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磁性細菌とはグラム陰性細菌で生体内で磁石を生産する細菌である。この磁石はマグネトソーム(magnetosome)と呼ばれ、大きさ50nm程度の磁気微粒子が脂質二重膜に覆われた構造を持つ。磁気微粒子はマグネタイト(Fe3O4)またはグレガイト(Fe3S4)で構成されることが知られている。 参考資料 [1] http //pronet.s.kanazawa-u.ac.jp/j/jisei.html [2] http //www.bio.nite.go.jp/ngac/magnet.html Total: - Today: - Yesterday: - トップページの合計: -
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↑真核生物 Kolodziej Stoeck 2007 を改変 ストラメノパイル / ストラメノパイラ (Straminipila) = 広義の不等毛類 (Heterokonta = Heterokontae) = 広義の不等毛植物 (Heterokontophyta) incertae sedis アクチノフリス科 (Actinophryidae) ラフィド藻 (Raphydophyceae) シヌラ目 (Synurales) オパリナ綱 (Opalinea) [- ブラストシスティス] N.N.MAST‐6 MAST‐9 N.N.ラビリンチュラ綱 (Labyrinthulea = Labyrinthista = Labyrinthulomycota = Labyrinthomorpha)ヤブレツボカビ + Aurantiochytrium + Schizochytrium + Japonochytrium + Parietichytrium N.N.オブロンギキトリウム (Oblongichytrium) ラビリンチュラ目 (Labyrinthulales) = ラビリンチュラ科 (Labyrinthulaceae = Labyrinthulidae) N.N.MAST‐11 MAST‐7 MAST‐5 MAST‐4 MAST‐8 N.N.N.N.ビコエカ綱 (Bicoecea)ボロカ目 (Borokales) = ボロカ (Boroka) シアトボド上目 + プラシディア亜綱ビコソエカ目 (Bicoecales) = ビコソエカ (Bicoeca) プセウドデンドロモナス目 (Pseudodendromonadales) プラシディア亜綱 + アノエカ目アノエカ目 (Anoecales) プラシディア亜綱 (Placidae) MAST‐13 N.N.MAST‐3 ブラストキスティス綱 (Blastocystea) = ブラストキスティス目 (Blastocystales) = ブラストシスチス / ブラストシスティス (blastocystis) MAST‐12 “偽菌類 (Pseudofungi)” + オクロ植物門MAST‐2 N.N.ビギロモナデア (Bigyromonadea) = デヴェロパイェラ (Developayella) サカゲツボカビ類 (Hyphochytrea) N.N.卵菌 (Öomycetes = Oomycetes = Oomycota) = Peronosporomycetes MAST‐1 ピルソニア (Pirsonia) 不等毛類 (Heterokonta = Heterokontae) = 不等毛植物 (Heterokontophyta) = 不等毛藻 (Heterokontophyceae) = オクロ植物 (Ochrophyta) → 褐藻 ビコエカ類を含む系統と不等毛藻を含む系統が近縁という(弱い)結果が出ていますが、多分岐にしました。Tsui et al. (2009) は、ラビリンチュラを含む系統とビコエカ類を含む系統が近縁としています。 ビコエカ綱の内部系統は他ソースより補完しました。Kolodziej Stoeck 2007 ではプラシディア亜綱、アノエカ目、プセウドデンドロモナス目のみ解析されています。 ラビリンチュラの内部系統は Tsui et al. (2009) によりました。 MAST = uncultured marine stramenopiles。 Kolodziej Stoeck 2007. Cellular Identification of a Novel Uncultured Marine Stramenopile (MAST-12 Clade) Small-Subunit rRNA Gene Sequence from a Norwegian Estuary by Use of Fluorescence In Situ Hybridization-Scanning Electron Microscopy. (HTML) Kolodziej Stoeck 2007. Cellular Identification of a Novel Uncultured Marine Stramenopile (MAST-12 Clade) Small-Subunit rRNA Gene Sequence from a Norwegian Estuary by Use of Fluorescence In Situ Hybridization-Scanning Electron Microscopy. (PDF) 気まぐれ生物学 網の目を行くアメーバの進化 ( Tsui et al. (2009) の紹介) ISOPの分類にもとづいた系統 ストラメノパイル (Straminipila) オパリナ亜門 (Opalinata)プロテロモナス綱 (Proteromonadea) オパリナ綱 (Opalinea) ブラストシスチス / ブラストシスティス (blastocystis) ビコソエカ目 (Bicosoecida) ラビリンチュラ綱 / ラビリンツラ綱 (Labyrinthulomycetes)ラビリンチュラ科 / ラビリンツラ科 (Labyrinthulaceae) ヤブレツボカビ科 (Thraustochytriaceae) サカゲツボカビ目 (Hyphochytriales)アニソルピディウム科 (Anisolpidiaceae) サカゲツボカビ科 (Hyphochytridiomycetaceae) サカゲカビ科 (Rhizidiomycetaceae) 卵菌 (Peronosporomycetes = Öomycetes = Oomycetes = Oomycota) アクチノフリス科 (Actinophryidae) ボリド藻 (Bolidomonas / Bolidophyceae) 黄金色藻 / 黄金色植物 / 黄色鞭毛藻 (Chrysophyta = Chrysophyceae)ヒカリモ目 /コガネイロヒゲムシ目 (Chromulinales) ヒベルディア (Hibberdia = Hibberdiales) オクロモナス目 (Ochromonadales) ディクティオカ藻 (Dictyochophyceae)ディクティオカ目 (Dictyochales) ペディネルラ目 (Pedinellales) リゾクロムニナ目(Rhizochromulinales) ユースチグマトス目 (Eustigmatales) ペラゴ藻 (Pelagophyceae)ペラゴモナス目 (Pelagomonadales) サルキノクリシス目 / サルシノクリシス目 (Sarcinochrysidales) フェオタムニオン藻 / ファエオタムニオン藻 (Phaeothamniophyceae)フェオタムニオン目 / ファエオタムニオン目 (Phaeothamniales) プレウロクロリデラ目 (Pleurochloridales) ピンギオクリシス目 (Pinguiochrysidales) ラフィド藻 (Raphydophyceae) スキゾクラディア (Schizocladia) シヌラ目 (Synurales) 不等毛藻 / 不等毛植物 (Heterokontophyta) = 不等毛類 (Heterokonta / Heterokontae) = 黄緑藻 / 黄緑色藻 / 黄緑植物 / 黄緑色植物 (Xanthophyceae / Xantophyta)トリボネマ目 (Tribonematales) フシナシミドロ目 (Vaucheriales) 褐藻 / 褐色植物 (Phaeophyta = Phaeophyceae)アスコセイラ目 (Ascoseirales) ムチモ目 (Cutleriales) ウルシグサ目 / うるしぐさ目 (Desmarestiales) アミジグサ目 / あみじぐさ目 (Dictyotales) シオミドロ目 / しおみどろ目 (Ectocarpales) ヒバマタ目 / ひばまた目 (Fucales) イシゲ (Ishige = Ishigeacea) コンブ目 / こんぶ目 (Laminariales) シトタムナス目 (Scytothamnales) クロガシラ目 / くろがしら目 (Sphacelariales) ケヤリモ目 / けやりも目 / ケヤリ目 / けやり目 (Sporochnales) ウスバオオギ目 / うすばおおぎ目 / シリンゴデルマ目 (Syringodermatales) チロプテリス目 / ティロプテリス目 (Tilopteridales) 珪藻 / 珪藻植物 (Bacillariophyta = Diatomea)コアミケイソウ亜門 (Coscinodiscophytina)パラリア類 (Paralids) メロシラ類 (Melosirids) コアミケイソウ類 / コスキノディスクス類 (Coscinodiscids) クモノスケイソウ類 / アラクノイディスクス類 (Arachnoidiscids) ツツガタケイソウ類 / リゾソレニア類 (Rhizosolenids) コレスロン類 (Corethrids) 珪藻下門(暫訳) (Bacillariophytina)メディア藻(暫訳) Mediophyceae 珪藻綱(暫訳) (Bacillariophyceae)
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↑左右相称動物 冠輪動物の系統 冠輪動物 (Lophotrochozoa) = 螺旋卵割動物 / スピラリア (Spiralia) 二胚虫類 (Dicyemida) = 菱形動物 (Rhombozoa) 外肛動物 (Ectoprocta) = 狭義の苔虫動物 / 狭義の苔虫類 (Bryozoa sensu stricto) 毛顎動物 / 毛顎類 (Chaetognata) 扁平動物 (Platyzoa)N.N.腹毛動物 / 腹毛虫 (Gastrotricha) →イタチムシ 扁形動物 (Platyhelminthes = Plathelminthes) →プラナリア 担顎動物 (Gnathifera) 腕動物 (Brachiozoa) = フォロノゾア (Phoronozoa) = 狭義の触手冠動物 / 狭義のロフォフォラータ (Lophophorata sensu stricto)箒虫動物 (Phoronida) ⊃ホウキムシ 有関節類 (Articulata) = 嘴殻類 (Rhynchonelliformea) 無関節類 (Inarticulata)舌殻類 (Linguliformea) ⊃シャミセンガイ 頭殻類 (Craniiformea) 内肛動物 (Entoprocta) ⊃スズコケムシ 有輪動物 (Cycliophora) = シンビオン (Symbiida = Symbiidae = Symbion pandra) 紐形動物 (Nemertea = Nemertini = Nemertina) = 吻腔動物 (Rhynchocoela) ⊃ヒモムシ 軟体動物 (Mollusca) 広義の環形動物 (Annelid sensu lato)スイクチムシ類 / 吸口虫類 (Myzostomida) 環形動物 (Annelida) = プルヴィニフェラ (Pulvinifera) これらの中で扁平動物が最初に分岐するという説があり、その場合、扁平動物を含む系統をスピラリア、含まない系統を冠輪動物と呼び分けることがあります。 「外肛動物 + 内肛動物」をかつて苔虫動物といいましたが、このグループは多系統であり、現在は苔虫動物は外肛動物のシノニムとされることが多いです。 吸口虫の系統ははっきりしません。かつては環形動物に含められていました。Bleidorn et al. 2007では、環形動物に近縁もしくは含まれるという結果が出ています。 扁平動物の扁形動物やシンデルマータに近縁とされるか含められることもあります。Dunn et al. 2008では扁平動物の顎口動物と姉妹群をなしました。Passamaneck 2006 では外肛動物の内群となりましたが、この結果は彼ら自身が疑わしいとしています。 星口動物、ユムシ動物、有鬚動物は環形動物に含めました。 きまぐれ生物学≫吸口虫とは何者か? 仮説的な系統を追加 冠輪動物 (Lophotrochozoa) = 螺旋卵割動物 / スピラリア (Spiralia) 二胚虫類 (Dicyemida) = 菱形動物 (Rhombozoa) 外肛動物 (Ectoprocta) = (狭義の)苔虫動物 / 苔虫類 (Bryozoa) 毛顎動物 / 毛顎類 (Chaetognata) 扁平動物 (Platyzoa)N.N.腹毛動物 / 腹毛虫 (Gastrotricha) →イタチムシ 扁形動物 (Platyhelminthes = Plathelminthes) →プラナリア 担顎動物 (Gnathifera) 冠動物 / ロフォゾア (Lophozoa) = 狭義の冠輪動物 (Lophotrochozoa)腕動物 (Brachiozoa) = フォロノゾア (Phoronozoa) = 狭義の触手冠動物 / 狭義のロフォフォラータ (Lophophorata sensu stricto)箒虫動物 (Phoronida) ⊃ホウキムシ 腕足動物 / 腕足類 (Brachiopoda) = 触手動物 (Tentaclata)有関節類 (Articulata) = 嘴殻類 (Rhynchonelliformea) 無関節類 (Inarticulata)舌殻類 (Linguliformea) ⊃シャミセンガイ 頭殻類 (Craniiformea) 担輪動物 (Trochozoa)Incertae sedis ロバトセレブルム (Lobatocerebromorpha = Lobatocerebrum psammicola) Incertae sedis ジェンナリア (Jennaria pulchra)曲形動物 (Kamptozoa)内肛動物 (Entoprocta) ⊃スズコケムシ 有輪動物 (Cycliophora) = シンビオン (Symbiida = Symbiidae = Symbion pandra) 真担輪動物 (Eutrochozoa)紐形動物 (Nemertea = Nemertini = Nemertina) = 吻腔動物 (Rhynchocoela) ⊃ヒモムシ 新担輪動物 (Neotrochozoa)軟体動物 (Mollusca) 広義の環形動物 (Annelid sensu lato)スイクチムシ類 / 吸口虫類 (Myzostomida) 環形動物 (Annelida) = プルヴィニフェラ (Pulvinifera) 外肛動物の位置づけは不確実です。冠動物に含めることはよくあります (Cavalier-Smithなど)。以前は触手冠動物に含めることもありましたが、現在では主流ではありません。 ここでは扁平動物と冠動物を共に単系統としましたが、どちらかを側系統とする説も多いです。以前は扁平動物を側系統とすることが多かったですが、近年は扁平動物を単系統とすることが多いようです。 ロバトセレブルムとジェンナリアは、通常は環形動物に含められますが、担輪動物の初期に分岐したという説もあります。 Podsiadlowski et al. 2009 冠輪動物 (Lophotrochozoa) = 螺旋卵割動物 / スピラリア (Spiralia) N.N.箒虫動物 (Phoronida) ⊃ホウキムシ 紐形動物 (Nemertea = Nemertini = Nemertina) = 吻腔動物 (Rhynchocoela) ⊃ヒモムシ 内肛動物 (Entoprocta) ⊃スズコケムシ 軟体動物 (Mollusca) N.N.N.N.外肛動物 (Ectoprocta) = (狭義の)苔虫動物 / 苔虫類 (Bryozoa) 腕動物 (Brachiozoa) 広義の環形動物 (Annelid sensu lato)スイクチムシ類 / 吸口虫類 (Myzostomida) 環形動物 (Annelida) = プルヴィニフェラ (Pulvinifera) Podsiadlowski et al. 2009. Phylogeny and mitochondrial gene order variation in Lophotrochozoa in the light of new mitogenomic data from Nemertea Min Park 2009 冠輪動物 (Lophotrochozoa) = 螺旋卵割動物 / スピラリア (Spiralia) N.N.N.N.扁平動物 (Platyzoa) 毛顎動物 / 毛顎類 (Chaetognata) 外肛動物 (Ectoprocta) = (狭義の)苔虫動物 / 苔虫類 (Bryozoa) 冠動物 / ロフォゾア (Lophozoa) = 狭義の冠輪動物 (Lophotrochozoa)N.N.N.N.腕足動物 / 腕足類 (Brachiopoda) 環形動物 (Annelida) = プルヴィニフェラ (Pulvinifera) [+星口動物 (Sipuncula), ユムシ動物 (Echiura)] 軟体動物 (Mollusca) N.N.箒虫動物 (Phoronida) 内肛動物 (Entoprocta) Min Park. 2009. Eurotatorian paraphyly Revisiting phylogenetic relationships based on the complete mitochondrial genome sequence of Rotaria rotatoria (Bdelloidea Rotifera Syndermata) Passamaneck 2006による系統 冠輪動物 (Lophotrochozoa) = 螺旋卵割動物 / スピラリア (Spiralia) Incertae sedis 二胚虫類 (Dicyemida) = 菱形動物 (Rhombozoa) 外肛動物 (Ectoprocta) = (狭義の)苔虫動物 / 苔虫類 (Bryozoa) N.N.星口動物 / 星虫類 (Sipuncula) ⊃ホシムシ ※担輪動物 N.N.舌殻類 (Linguliformea) ⊃シャミセンガイ ※触手冠動物 N.N.箒虫動物 (Phoronida) ⊃ホウキムシ ※触手冠動物 N.N.軟体動物 (Mollusca) ※担輪動物 N.N.N.N.頭殻類 (Craniiformea) ※触手冠動物 環形動物 (Annelida) ※担輪動物 N.N.有関節類 (Articulata) = 嘴殻類 (Rhynchonelliformea) ※触手冠動物 N.N.紐形動物 (Nemertea = Nemertini = Nemertina) = 吻腔動物 (Rhynchocoela) ⊃ヒモムシ ※担輪動物 広義の扁平動物 (Platyzoa sensu lato)曲形動物 (Kamptozoa)内肛動物 (Entoprocta) ⊃スズコケムシ ※担輪動物 有輪動物 (Cycliophora) = シンビオン (Symbion pandra = Symbiida = Symbiidae) ※担輪動物 扁平動物 (Platyzoa) 扁平動物と姉妹群をなすと考えられていた冠動物が、側系統となっています。これは、扁平動物は二次的に体制を単純化した生物であるということを示唆します。 冠動物の下位グループも、曲形動物を除きのきなみ側系統ないし多系統となっています。 ここでは、ユムシ動物、有鬚動物を環形動物に含めました。星口動物は含めていません。 Passamaneck 2006 Dunn et al 2008による系統 冠輪動物 (Lophotrochozoa) = 螺旋卵割動物 / スピラリア (Spiralia) N.N.外肛動物 (Ectoprocta) = (狭義の)苔虫動物 / 苔虫類 (Bryozoa) 扁平動物 (Platyzoa) [+ スイクチムシ類 + 無腸動物] 冠動物 / ロフォゾア (Lophozoa) = 狭義の冠輪動物 (Lophotrochozoa)曲形動物 (Kamptozoa) Clade C軟体動物 (Mollusca) Clade B環形動物 (Annelida) = プルヴィニフェラ (Pulvinifera) 触手冠動物 + 紐形動物 = Clade A箒虫動物 (Phoronida) ⊃ホウキムシ N.N.有関節類 (Articulata) = 嘴殻類 (Rhynchonelliformea) 紐形動物 (Nemertea = Nemertini = Nemertina) = 吻腔動物 (Rhynchocoela) ロフォゾア内の系統が従来と大きく異なりますが、OTUが少ないのではっきりしません。ブートストラップも低いです。